Семинар обычно проводится по четвергам в 16:00 в
Лаборатории математической биологии и биоинформатики ИПММ Санкт-Петербургского Политехнического университета
ул. Политехническая, 29, Научно-исследовательский корпус, в помещении А.3.30

 

 

Руководитель семинара: Самсонова Мария Георгиевна
  m.samsonova@spbstu.ru
Секретарь: Екатерина Осягина
  osyaginae@mail.ru

 

Как нас найти

Семинар
23.03.2017, 16:00 Чижов А. (ФТИ РАН)

Эпилептические интериктальные разряды в срезах энторинальной коры крысы: эксперимент и модель (Aннотация)

Семинар
09.03.2017, 16:00 Иголкина А. (СПбПУ Петра Великого)

final rat testАнализ вариабельности экспрессии между больными шизофренией и здоровыми людьми (Aннотация)

Семинар
20.02.2017, 16:00 Новикова Л. (ВИР им. Вавилова)

Реакция сельскохозяйственных растений на изменения климата ЕТ РФ (Aннотация)

Семинар
09.02.2017, 16:00 Чернова В. (ИЦиГ СО РАН)

Компьютерный анализ особенностей экспрессии транспортеров ауксина семейства PIN в корне Arabidopsi thaliana L. (Aннотация)

Семинар
26.01.2017, 16:00 Петухов В. (СПбПУ Петра Великого)

Точное оценивание уровня экспрессии генов в droplet-based single-cell RNA-seq эксперимента (Aннотация)

10.11.2016, 16:00Черткова А. (СПбПУ Петра Великого)

Моделирование эволюции регуляторных последовательностей ДНК (Aннотация)

 

15.06.2016, 16:00 Уткин Л.В.1, Егоров А.А. 2,3(1 СПбПУ Петра Великого, 2 СПбГЛТУ им. С.М. Кирова, 3 СПбГУ)

Робастный статистический анализ наблюдений зимостойкости хвойных на основе комбинации регрессионных и интервальных статистических моделей (Aннотация)

 

01.06.2016, 16:00 Dr. Magnus Fontes (Institut Pasteur, France)

Mathematical modelling for the Healthy Human Global project. (Aннотация)

 

06.04.2016, 16:00 Кулаковский И.В.(Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН)

Коллекция моделей мотивов сайтов связывания для факторов транскрипции мыши и человека: обзор данных, программных инструментов и практических приложений для задач регуляторной геномики (Aннотация)

 

30.03.2016, 16:00 Зубаирова У.С. (ИЦиГ СО РАН)

Компьютерное моделирование морфодинамики в меристемах растений с учётом морфогенетической регуляции и биомеханических свойств клеток (Aннотация)

 

23.03.2016, 16:00 Иголкина А.А. (СПбГПУ)

Поиск отклонений в работе сигнальных путей у больных шизофренией с помощью SEM (Structural Equation Modeling).

 

02.03.2016, 16:00 Уткин Л.В. (СПбГПУ)

Простой алгоритм полногеномного поиска ассоциаций для оценки аддитивного и эпистатического эффекта (Aннотация)

 

17.02.2016, 16:00 Dmytro Grytskyy (Juelich Center, Juelich, Germany)

Mutual interplay of activity and connectivity in networks of point neurons (Aннотация)

 

25.11.2015, 15:00 Константин Козлов, Виталий Гурский, Иван Кулаковский, Арина Дымова и Мария Самсонова (СПбГПУ)

Анализ функциональной значимости сайтов связывания в модели сети генов gap дрозофилы. (Aннотация)

 

11.11.2015, 15:00 К.В. Вяткина (СПбГУ, СПбАУ)

De novo секвенирование белков на основе масс-спектрометрических данных, полученных с использованием технологии top-down (Aннотация)

 

03.06.2015, 15:00 С. Казаков, А. Шалыто (Университет ИТМО)

ITMO Genome Assembler: de novo сборка генома в условиях ограниченных системных ресурсов. (Aннотация)

 

15.05.2015, 15:00 С.А. Руколайне (ФТИ РАН)

Линейное уравнение типа Больцмана с произвольным распределением длины свободного пробега и асимптотические приближения к нему (упрощенная модель внутриклеточного транспорта) (Aннотация)

 

17.04.2015, 15:00 К. Козлов, А. Соколкова (СПбГПУ)

Новые средства ПО ProStack для изучения эндоцитоза в клетках HeLa. (Aннотация)

 

18.03.2015, 15:00 Чижов А. (МФТИ)

Математическая модель статистического ансамбля нейронов как элемент модели зрительной коры. (Aннотация)

 

11.03.2015, 15:00 Потокина Е.К.(ГНУ ВНИИ растениеводства им. Н. И. Вавилова)

Геномный скрининг коллекций генетических ресурсов растений ВИР для повышения эффективности отечественной селекции. (Aннотация)

 

27.02.2015, 15:00 Дук М. (СПбГПУ)

Динамика контуров с упреждением зависит от типа регулятора в непрямой ветке регуляции

 

13.02.2015, 15:00 Иголкина А.А. (СПбГПУ)

Разработка метода предсказания процентного содержания типов клеток в образцах крови человека

 

30.01.2015, 15:00 Анастасия Терских (СПбГПУ)

Регуляторные совпадения в программах раннего развития дивергировавших видов насекомых

 

12.12.2014, 16:00 Юсупов А.Н. («МЕДИНЕФ»)

Friendly Fire. Взгляд кибернетика на атеросклероз (Aннотация)

 

28.11.2014, 16:00 В.Гурский (ФТИ РАН)

Трансляция генетической изменчивости на уровень экспрессии генов для генной сети gap генов Дрозофилы

 

21.11.2014, 16:00 Герман Демидов (студент, маг. прог. по биоинформатике, Санкт-Петербургский Академический университет)

Стохастическое моделирование молекулярных конфигураций энхансера: литературный обзор и постановка задачи. (Abstract)

 

22.07.2014, 13:00 Д.Гребеньков (Лаборатория Физики Конденсированного Состояния CNRS)

Моделирование процессов переноса в сложных системах: от клеток к органам (Abstract)

 

11.04.2014, 13:00 А.Писарев (СПбГПУ)

Трекинг частиц в биологических видеоизображениях

 

17.01.2014, 13:00 Сергей Малов (СПбГУ, Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г. Добржанского)

О проблеме поиска генетических закономерностей (Abstract)

 

15.11.2013, 13:00 Сергей Руколайне (ФТИ РАН)

Некоторые простейшие модели активного внутриклеточного транспорта

 

01.11.2013, 15:00 Елена Корнилова (ИНЦ РАН)

Эндоцитоз рецептора ЭФР как модель везикулярного транспорта (Аннотация)

 

25.10.2013, 13:00 Анна Иголкина (СПбГПУ)

О предстоящей стажировке на кафедре генетики человека Медицинского центра Университета Гронингена (Аннотация)

 

11.10.2013, 13:00 Кира Вяткина (Проблемная лаборатория вычислительной биологии СПб Академического Университета)

Секвенирование антител на основе top-down масс-спектров (Аннотация)

 

5.04.2013, 13:00 Елена Корнилова (ИНЦ РАН)

Прижизненный анализ транспорта и слияний эндосом, содержащих Qds, в культивируемых клетках. (Аннотация)

 

29.03.2013, 13:00 А.Жернакова (Университет г.Гронинген (UMCG), Нидерланды)

Генетика заболеваний иммунной системы - история, полногеномные методы анализа, дальнейшие перспективы (Аннотация)

 

15.03.2013, 13:00 С.A. Руколайне, А.M. Самсонов (ФТИ РАН)

Модели транспорта вещества, связанные с уравнением типа Джеффриса

 

22.02.2013, 13:00 И.Гула (СПбГПУ НОЦ "Математическая биология систем")

Модель генной экспрессии, основанная на телеграфном уравнении

 

18.01.2013, 13:00 М. Генаев (Институт Цитологии и Генетики, Новосибирск)

Разработка методов автоматического определения количественных характеристик опушения листа (Аннотация)

 

24.12.2012, 13:00 студенты группы 5057/4 (СПбГПУ)

Защита НИР студентами группы 5057/4

 

23.11.2012, 13:00 Д.Тодоров (СПбГУ, СПбГПУ НОЦ "Математическая биология систем")

Чувствительность и устойчивость стохастических моделей

 

9.11.2012, 13:00 E.M.Мясникова (СПбГПУ НОЦ "Математическая биология систем")

Критерий оценки предсказательной силы модели генных сетей (Аннотация)

 

11.07.2012, 15:00 Дмитрий Тодоров (СПбГУ, СПбГПУ НОЦ "Математическая биология систем")

Аттракторы, их бассейны и чувствительность: Обзор методов и программ в области системной биологии

 

5.07.2012, 15:00 А.Писарев (Государственный Политехнический Университет)

Применение эвристических методов в решении обратных задач

 

20.04.2012, 11:00 Е.Андронов (ГНУ ВНИИСХМ)

Эволюционное пространство гена 16S рРНК – проблемы и перспективы (Аннотация)

 

20.04.2012, 15:00 Lude Franke (Department of Genetics, University Medical Centre Groningen, the Netherlands)

Understanding the consequences of genetic variation (Abstract)

 

30.03.2012 С.Березин (Государственный Политехнический Университет)

Применение HMM к отбору кандидатов в задаче поиска сайтов редактирования РНК. II часть

 

16.03.2012 Е.Мясникова (Государственный Политехнический Университет)

Анализ идентифицируемости параметров модели регуляторных взаимодействия генов (Аннотация)

 

2.03.2012 С.Березин (Государственный Политехнический Университет)

Применение HMM к отбору кандидатов в задаче поиска сайтов редактирования РНК. (Аннотация)

 

24.02.2012 А.Писарев (СПбГПУ)

Многокритериальный подход к реконструкции генных сетей