Семинар обычно проводится по четвергам в 16:00 в
Лаборатории математической биологии и биоинформатики ИПММ Санкт-Петербургского Политехнического университета
ул. Политехническая, 29, Научно-исследовательский корпус, в помещении А.3.30

 

 

Руководитель семинара: Самсонова Мария Георгиевна
  m.samsonova@spbstu.ru
Секретарь: Екатерина Осягина
  osyaginae@mail.ru

 

Как нас найти

Семинар
25.05.2017, 16:00 Светлана Суркова (СПбПУ)

ssurkova 25 05 2017 fig1

Анализ транскрипционной активности генов сегментации в сравнении с картинами экспрессии на уровне белка

Аннотация:

В ранних эмбрионах дрозофилы проведена пространственно-временная оценка транскрипционной активности генов в сравнении с их экспрессией на уровне белка. Анализ сделан для эмбрионов дикого типа, нуль-мутантов по гену Kruppel (Kr) и гетерозигот Kr+/Kr-. На основе пространственного распределения транскрипционно активных ядер в эмбрионах выявлен различный характер инициации транскрипции для областей экспрессии генов gap и pair-rule. Рассмотрена колокализация транскрипционной активности генов, являющихся взаимными репрессорами.


Изучены различия характера экспрессии генов giant, hunchback и even skipped на уровне мРНК и белка. Разница в пространственных позициях границ экспрессии на уровне белка и мРНК является вероятной причиной существенного снижения интенсивности постериорной области giant на уровне мРНК у нуль-мутантов. У гетерозигот в начале цикла 14А постериорные области экспрессии генов имеют пространственные координаты, близкие к таковым у нуль-мутантов. В ходе цикла 14А эти области сдвигаются к позициям дикого типа, однако сохраняют повышенный уровень позиционной вариабельности, свойственный для нуль-мутантов. Возможно, следствием повышенной вариабельности является то, что гетерозиготы Kr+/Kr-, в отличие от нуль-мутантов по Kr, выживают, но часто имеют дефекты развития.