Семинар обычно проводится по четвергам в 16:00 в
Лаборатории математической биологии и биоинформатики ИПММ Санкт-Петербургского Политехнического университета
ул. Политехническая, 29, Научно-исследовательский корпус, в помещении А.3.30

 

 

Руководитель семинара: Самсонова Мария Георгиевна
  m.samsonova@spbstu.ru
Секретарь: Екатерина Осягина
  osyaginae@mail.ru

 

Как нас найти

Семинар
29.03.2018, 16:00 Анна Иголкина (СПбПУ)

Байесовский подход к анализу изменений в генетических сетях во время дифференциации клеток крови.

Аннотация:

Вместе с процессом дифференциации клеток крови (в моноциты, нейтрофилы, лимфоциты) от общего недифференцированного состояния меняются и каузальные связи между генами в генетических сетях. При разработке моделирования изменения генетических сетей при дифференцировке использовалось следующие предположения: (1) изменение ковариационной структуры уровней экспрессии генов так же как и количественных характеристик ген-генных взаимодействий происходило подобно Винеровскому процессу вдоль графа дифференцирования; (2) в каждом узле графа генетическая сеть была работоспособной, то есть по ней могла бы быть построена правдоподобная SEM модель (Structural Equation Modeling).

Баейсовский подход к оценке параметров SEM и моделирования Винеровского процесса вдоль графа, позволил получить состояния генетических сетей в “недифференцированных” состояниях.