Семинар обычно проводится по четвергам в 16:00 в
Лаборатории математической биологии и биоинформатики ИПММ Санкт-Петербургского Политехнического университета
ул. Политехническая, 29, Научно-исследовательский корпус, в помещении А.3.30

 

 

Руководитель семинара: Самсонова Мария Георгиевна
  m.samsonova@spbstu.ru
Секретарь: Екатерина Осягина
  osyaginae@mail.ru

 

Как нас найти

Семинар
09.02.2017, 16:00 Чернова В. (ИЦиГ СО РАН)

Компьютерный анализ особенностей экспрессии транспортеров ауксина семейства PIN в корне Arabidopsi thaliana L. (Aннотация)

Семинар
26.01.2017, 16:00 Петухов В. (СПбПУ Петра Великого)

Точное оценивание уровня экспрессии генов в droplet-based single-cell RNA-seq эксперимента (Aннотация)

Семинар
19.01.2017, 16:00 Ковалев М., Козлов К. (СПбПУ Петра Великого)

Обработка экспериментальных 3D изображений глазного диска плодовой мушки (Aннотация)

Семинар
15.12.2016, 16:00, 16:00 Дмитренко А. (СПбПУ Петра Великого)

Стохастическое моделирование молекулярных конфигураций регуляторных районов ДНК в эукариотических клетках (Aннотация)

Семинар
08.12.2016, 16:00 Нестеренко А. (СПбПУ Петра Великого)

Саморегуляция морфогенетических градиентов позвоночных за счет адсорбции морфогенов на компонентах внеклеточного матрикса (Aннотация)

Семинар
24.11.2016, 16:00 Плеханова Е. (СПбПУ Петра Великого) (СПбПУ Петра Великого)

Genomic and phenotypic analysis of Vavilov’s historic landraces reveals the impact of environment and genomic islands of agronomic traits (Aннотация)

Семинар
17.11.2016, 16:00 Воронов Д. (СПбПУ Петра Великого)

Численное решение обратной задачи фармакокинетики (Aннотация)

10.11.2016, 16:00Черткова А. (СПбПУ Петра Великого)

Моделирование эволюции регуляторных последовательностей ДНК (Aннотация)

 

15.06.2016, 16:00 Уткин Л.В.1, Егоров А.А. 2,3(1 СПбПУ Петра Великого, 2 СПбГЛТУ им. С.М. Кирова, 3 СПбГУ)

Робастный статистический анализ наблюдений зимостойкости хвойных на основе комбинации регрессионных и интервальных статистических моделей (Aннотация)

 

01.06.2016, 16:00 Dr. Magnus Fontes (Institut Pasteur, France)

Mathematical modelling for the Healthy Human Global project. (Aннотация)

 

06.04.2016, 16:00 Кулаковский И.В.(Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН)

Коллекция моделей мотивов сайтов связывания для факторов транскрипции мыши и человека: обзор данных, программных инструментов и практических приложений для задач регуляторной геномики (Aннотация)

 

30.03.2016, 16:00 Зубаирова У.С. (ИЦиГ СО РАН)

Компьютерное моделирование морфодинамики в меристемах растений с учётом морфогенетической регуляции и биомеханических свойств клеток (Aннотация)

 

23.03.2016, 16:00 Иголкина А.А. (СПбГПУ)

Поиск отклонений в работе сигнальных путей у больных шизофренией с помощью SEM (Structural Equation Modeling).

 

02.03.2016, 16:00 Уткин Л.В. (СПбГПУ)

Простой алгоритм полногеномного поиска ассоциаций для оценки аддитивного и эпистатического эффекта (Aннотация)

 

17.02.2016, 16:00 Dmytro Grytskyy (Juelich Center, Juelich, Germany)

Mutual interplay of activity and connectivity in networks of point neurons (Aннотация)

 

25.11.2015, 15:00 Константин Козлов, Виталий Гурский, Иван Кулаковский, Арина Дымова и Мария Самсонова (СПбГПУ)

Анализ функциональной значимости сайтов связывания в модели сети генов gap дрозофилы. (Aннотация)

 

11.11.2015, 15:00 К.В. Вяткина (СПбГУ, СПбАУ)

De novo секвенирование белков на основе масс-спектрометрических данных, полученных с использованием технологии top-down (Aннотация)

 

03.06.2015, 15:00 С. Казаков, А. Шалыто (Университет ИТМО)

ITMO Genome Assembler: de novo сборка генома в условиях ограниченных системных ресурсов. (Aннотация)

 

15.05.2015, 15:00 С.А. Руколайне (ФТИ РАН)

Линейное уравнение типа Больцмана с произвольным распределением длины свободного пробега и асимптотические приближения к нему (упрощенная модель внутриклеточного транспорта) (Aннотация)

 

17.04.2015, 15:00 К. Козлов, А. Соколкова (СПбГПУ)

Новые средства ПО ProStack для изучения эндоцитоза в клетках HeLa. (Aннотация)

 

18.03.2015, 15:00 Чижов А. (МФТИ)

Математическая модель статистического ансамбля нейронов как элемент модели зрительной коры. (Aннотация)

 

11.03.2015, 15:00 Потокина Е.К.(ГНУ ВНИИ растениеводства им. Н. И. Вавилова)

Геномный скрининг коллекций генетических ресурсов растений ВИР для повышения эффективности отечественной селекции. (Aннотация)

 

27.02.2015, 15:00 Дук М. (СПбГПУ)

Динамика контуров с упреждением зависит от типа регулятора в непрямой ветке регуляции

 

13.02.2015, 15:00 Иголкина А.А. (СПбГПУ)

Разработка метода предсказания процентного содержания типов клеток в образцах крови человека

 

30.01.2015, 15:00 Анастасия Терских (СПбГПУ)

Регуляторные совпадения в программах раннего развития дивергировавших видов насекомых

 

12.12.2014, 16:00 Юсупов А.Н. («МЕДИНЕФ»)

Friendly Fire. Взгляд кибернетика на атеросклероз (Aннотация)

 

28.11.2014, 16:00 В.Гурский (ФТИ РАН)

Трансляция генетической изменчивости на уровень экспрессии генов для генной сети gap генов Дрозофилы

 

21.11.2014, 16:00 Герман Демидов (студент, маг. прог. по биоинформатике, Санкт-Петербургский Академический университет)

Стохастическое моделирование молекулярных конфигураций энхансера: литературный обзор и постановка задачи. (Abstract)

 

22.07.2014, 13:00 Д.Гребеньков (Лаборатория Физики Конденсированного Состояния CNRS)

Моделирование процессов переноса в сложных системах: от клеток к органам (Abstract)

 

11.04.2014, 13:00 А.Писарев (СПбГПУ)

Трекинг частиц в биологических видеоизображениях

 

17.01.2014, 13:00 Сергей Малов (СПбГУ, Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г. Добржанского)

О проблеме поиска генетических закономерностей (Abstract)

 

15.11.2013, 13:00 Сергей Руколайне (ФТИ РАН)

Некоторые простейшие модели активного внутриклеточного транспорта

 

01.11.2013, 15:00 Елена Корнилова (ИНЦ РАН)

Эндоцитоз рецептора ЭФР как модель везикулярного транспорта (Аннотация)

 

25.10.2013, 13:00 Анна Иголкина (СПбГПУ)

О предстоящей стажировке на кафедре генетики человека Медицинского центра Университета Гронингена (Аннотация)

 

11.10.2013, 13:00 Кира Вяткина (Проблемная лаборатория вычислительной биологии СПб Академического Университета)

Секвенирование антител на основе top-down масс-спектров (Аннотация)

 

5.04.2013, 13:00 Елена Корнилова (ИНЦ РАН)

Прижизненный анализ транспорта и слияний эндосом, содержащих Qds, в культивируемых клетках. (Аннотация)

 

29.03.2013, 13:00 А.Жернакова (Университет г.Гронинген (UMCG), Нидерланды)

Генетика заболеваний иммунной системы - история, полногеномные методы анализа, дальнейшие перспективы (Аннотация)

 

15.03.2013, 13:00 С.A. Руколайне, А.M. Самсонов (ФТИ РАН)

Модели транспорта вещества, связанные с уравнением типа Джеффриса

 

22.02.2013, 13:00 И.Гула (СПбГПУ НОЦ "Математическая биология систем")

Модель генной экспрессии, основанная на телеграфном уравнении

 

18.01.2013, 13:00 М. Генаев (Институт Цитологии и Генетики, Новосибирск)

Разработка методов автоматического определения количественных характеристик опушения листа (Аннотация)

 

24.12.2012, 13:00 студенты группы 5057/4 (СПбГПУ)

Защита НИР студентами группы 5057/4

 

23.11.2012, 13:00 Д.Тодоров (СПбГУ, СПбГПУ НОЦ "Математическая биология систем")

Чувствительность и устойчивость стохастических моделей

 

9.11.2012, 13:00 E.M.Мясникова (СПбГПУ НОЦ "Математическая биология систем")

Критерий оценки предсказательной силы модели генных сетей (Аннотация)

 

11.07.2012, 15:00 Дмитрий Тодоров (СПбГУ, СПбГПУ НОЦ "Математическая биология систем")

Аттракторы, их бассейны и чувствительность: Обзор методов и программ в области системной биологии

 

5.07.2012, 15:00 А.Писарев (Государственный Политехнический Университет)

Применение эвристических методов в решении обратных задач

 

20.04.2012, 11:00 Е.Андронов (ГНУ ВНИИСХМ)

Эволюционное пространство гена 16S рРНК – проблемы и перспективы (Аннотация)

 

20.04.2012, 15:00 Lude Franke (Department of Genetics, University Medical Centre Groningen, the Netherlands)

Understanding the consequences of genetic variation (Abstract)

 

30.03.2012 С.Березин (Государственный Политехнический Университет)

Применение HMM к отбору кандидатов в задаче поиска сайтов редактирования РНК. II часть

 

16.03.2012 Е.Мясникова (Государственный Политехнический Университет)

Анализ идентифицируемости параметров модели регуляторных взаимодействия генов (Аннотация)

 

2.03.2012 С.Березин (Государственный Политехнический Университет)

Применение HMM к отбору кандидатов в задаче поиска сайтов редактирования РНК. (Аннотация)

 

24.02.2012 А.Писарев (СПбГПУ)

Многокритериальный подход к реконструкции генных сетей