Предсказание процентного содержанив клеток крови по данным об уровне экспрессии генов.

final rat testМногие ткани нашего организма содержат разные типов клеток, например кровь или печень. Процентное содержание типов клеток крови можно определить клиническим анализом. Сделать такой анализ для печени невозможно, но можно попытаться предсказать состав органа или ткани по информации об уровне экспрессии генов в ней. Наш метод решает такую задачу, используя в качестве примера кровь.


Предсказание вредных мутаций у собак

Замена нуклеотида ‒ наиболее распространенный вид изменений в ДНК у собак и других организмов. Такие замены могут вызывать болезни и, следовательно, быть вредными. У собак искусственный отбор, близкородственные скрещивания и периодическое уменьшение численности (например, во время войн) привели к накоплению большого числе вредных замен нуклеотидов в геноме. Для успешного разведения собак важно уметь предсказывать, какие замены будут вредными, а какие нет. Мы используем метод машинного обучения, называемый Transfer learning, чтобы сделать такие предсказания.